למעלה ממאה כתבי יד של ספר השורשים קיימים בעולם. השוואה ביניהם מעלה כי מאות קטעים באים רק בחלק מכתבי היד וחסרים באחרים. בדיקה מדגמית של כלל כתבי היד מורה כי יש כתבי יד המייצגים נוסח חסר יותר של החיבור, יש המייצגים נוסח מלא יותר, ויש מגוון רחב של מצבי ביניים.
נראה כי הקטעים האלה, רובם ככולם, נכתבו בידי רד"ק עצמו. התופעה משקפת את שלבי היצירה של הספר: תחילה נכתב נוסח קצר, ובמהלך השנים שכלל רד"ק את חיבורו והוסיף קטעים נוספים.
במהדורה החדשה של ספר השורשים שאני מכין יחד עם ד"ר יחיאל צייטקין בחרנו לכלול בקבוצת הביקורת כתבי יד המייצגים את הנוסח המלא ביותר וכתבי יד אחרים המייצגים את הנוסחים החסרים. באופן זה יוכלו המעיינים במהדורה לקבל מידע רב על דרך ההתפתחות של החיבור.
בהרצאה ייעשה ניסיון להוכיח כי ברוב המקרים אכן מדובר בתוספות המחבר עצמו ולא בתוספות של אחרים.
כמו כן יוצג מיון של קטעי התוספת לסוגיהם: תוספת פסוקים נוספים וצורות נוספות שהמחבר לא התייחס אליהם בשלב הכתיבה הראשון; תוספות עריכה שמטרתן הצגה נאה יותר של החומר, בלי תוספת מידע; התלבטות בפירושו של פסוק ספציפי; חזרה מקביעה שנאמרה במהדורה הראשונה או הסתייגות ומיתון שלה; תוספת של הערות אגב על ניקודן של מילים, על פירושי חז"ל ועוד; דיונים פילוסופיים רעיוניים; ודרכים פרשניות חדשות (כגון חילופי אטב"ח).