ההכרה בנחלים כצרכנים לגיטימיים במשק המים קיבלה ביטוי בהחלטת ממשלת ישראל משנת 2003, על "זכות המים לטבע", המתנה הקצאת מים לנחלים בקיום תכניות מים מאושרות. ברוח ההחלטה ולאחר שנים בהם הושג יישום חלקי החליט המשרד להגנת הסביבה למסד מסגרת
מנהלתית ומקצועית ברורה לקידום תכניות המים לכדי אישור ברשות המים.
לצורך יישום החלטת המשרד מועסק מאז תחילת 2012 פרויקטור - ח.ג.מ מהנדסים, הפועל לקידום תכניות מים לנחלים הנמצאות בשלבי הכנה ושיפוט שונים. העבודה כוללת מיפוי דינמי של התכניות, בדיקתה טמעת האלמנטים הסביבתיים הנדרשים, ליווי והדרכה צמודה של המתכננים וצוותי המים במנהלות הנחלים ברשויות הניקוז.
למול המורכבות הרבה של תכניות המים והמערכת המעורבת בהכנתן וקידומן נדרשה עבודת הכנה מאומצת שכללה תיאום ציפיות, קביעת מתכונת עבודה משותפת, ומסלול ברור ומוסכם לקידומן. כבר בשלבי העשייה הראשונים הוקם צוות מים ארצי לקביעת המסגרת המקצועית להכנת התכניות והתנאים לאישורן ונחתמו כתבי מינויים מיוחדים לצורך השתתפות נציגים מקצועיים מטעמו בוועדה לשיפוט ואישור התכניות ברשות המים.
צוות המים הארצי מקיים פעילות סדורה ופגישות בהם נדון מגוון רחב של נושאים מקצועיים ומנהלתיים בינהם: הגדרת הצרכים האקולוגיים וההידרולוגיים לשיקום כל נחל,יצירת אינטגרציה נכונה בין התכנון ההנדסי של משאבי המים לבין דרישות השיקום האקולוגי, התאמת כתבי הנחיות לתכנון לכל נחל, חיתוך עומק לנושאי התמחות רלוונטיים כגון תכניות ניטור, ממשקים אקולוגיים ושיפוט תכניות לקראת אישורן ברשות המים.
מאז תחילת עבודת צוות המים הארצי ועד היום אושרו תכניות מים לנחל קישון, לירדן הדרומי ולנחל תבור. כמו כן קודמו באופן משמעותי תכניות רבות נוספות
ובראשן נחל חרוד, ציפורי, ונעמן. הצוות כולל נציגים מהמשרד להגנת הסביבה, רשות הטבע והגנים, קרן קיימת לישראל וארגונים סביבתיים כמו החברה להגנת הטבע ועמותת צלול. צוות תכניות המים הארצי פועל בשיתוף פעולה מלא עם מנהלות הנחלים ברשויות הניקוז.
עבודת צוות המים הארצי בשנתיים האחרונות יצרה מומנטום חדש בתחום תכניות המים שאת ביטויו ניתן יהיה לראות כבר בעתיד הקרוב בזרימת מים טבעית בנחלים שאושרו והשבת בתי הגידול האקולוגיים.
