טיפוח מבוסס סמנים בתבלינים – בזיל זו רק ההתחלה

גידולי תבלין הינם מרכיב חשוב בסל המזון אותו אנו צורכים. אף על פי-כן, טיפוח מתקדם של תבלינים המבוסס על כלים גנומיים ומולקולריים בקושי קיים. מחסור בגנום רפרנס איכותי הוא לרוב המגבלה העיקרית, כאשר פולי-פלואידיות או חוסר בהירות לגביה ומהווים מכשול נוסף. ריחן הבזיל, Ocimum basilicum L, הוא גידול התבלין המוביל בישראל. זהו גידול פופולרי המוערך בשל השימושים הקולינריים שלו ובעיקר בזכות הארומה הייחודית. על-אף שבבזיל קיים מחקר בסיסי רב, הוא לא היה מבוסס על גנום רציף, דבר אשר הגביל את היכולות הגנטיות והטיפוחיות. כדי לסגור את הפער הזה, השתמשנו בריצוף HiFi ו-Hi-C לבניית גנום ברמת כרומוזומים עבור בזיל מטיפוס ג`נובז. גנום הבזיל הטטרפלואידי הורכב ל-26 כרומוזומים וסווג לתתי-הגנום שלו. השתמשנו באוכלוסייה בי-פרנטלית שמקורה בהכלאה בין בזיל ג`נובז לבזיל תאילנדי בעל ארומה אניסית כדי למפות QTL לתכונת סוג הארומה. גילינו QTL יחיד השולט על יחס החומרים הנדיפים באזור גנומי עם 95 גנים הכולל 15 גנים המקודדים לאנזים shikimate O-hydroxycinnamoyltransferase (HCT). מתוכם, רק הגן ObHCT1 הציג ביטוי גבוה יותר באופן משמעותי בזן הג`נובז והראה ביטוי ספציפי לטריכומות בלוטיות. גנום הרפרנס האיכותי והרציף נגיש כעת לציבור ב- BasilBase ואנו פיתחנו בעזרתו סמנים גם לעמידות לכשותית, עמידות לפוזריום, ומועד וצורת התפרחת. פרוייקט זה מראה כי בתקציב סביר, והמחיר ממשיך לרדת והטכנולוגיה להתפתח, ניתן היום לבצע גם טיפוח מבוסס סמנים לגידולי תבלין קטנים יותר כאשר פיתוח חומר גנטי מתקדם נהיה צוואר הבקבוק. כיום אנו עובדים על פיתוח אוכלוסיית כוסברה, שמהווה את אחד משני גידולי התבלינים המגודלים ביותר בישראל, בכדי לעשות שימוש גנטי בסמני עמידויות למחלות ופריחה.