מידול קהילות: שימוש בגנומיקה לניהול המיקרוביום במערכות חקלאיות

תפקוד מיטיב של קהילות מיקרוביאליות מהווה נדבך חיוני בתפקודן של מערכות חקלאיות ואקולוגיות. תכנון מושכל של הרכב ותפקוד הקהילות יכול לתמוך באופטימזציה של מספר רב של תהליכים קריטיים ולהביא לשיפור היבול ולהפחתת תשומות. המחקר שלנו עוסק ביישום ופיתוח של מודלים חישוביים לחיזוי והבנה של רשתות האינטראקציות הנוצרות בתוך קהילות מיקרוביאליות על סמך ניתוח של נתוני מטא/גנומיקה. עיבוד הנתונים הגנומיים משמש לתיאור מערך הגומלין הטרופי, חילופי חומרים, וחיזוי אינטראקציות תחרותיות ושיתופיות בתוך קהילות מיקרוביאליות טבעיות. בעזרת הסימולציות יניתן לחזות לחיזוי מסלולים פוטנציאליים לאופטימיזציה של תפקודים מוגדרים מראש. בהרצאה אתאר גישות ודוגמאות לעבודות בהם פתחנו אסטרטגיות לניהול המיקרוביום במערכות חקלאיות על סמך מידול של מידע גנומי.